Bakterie-DNA 16S rDNA

Indikation för 16S rDNA PCR är odlingsnegativ infektion eller misstänkt infektion i normalt steril lokal. Generellt bör de provmaterial som skickas in för denna analys alltid odlas samtidigt, även vid pågående antibiotikabehandling.

Metoden är inte lämplig vid misstanke om multimikrobiella och ytliga infektioner, såsom sår eller bukabscesser som förväntas innehålla ett flertal tarmbakterier.

Cerebrospinalvätska (Csv) bör i första hand analyseras med Meningit/encefalit-panel vid misstanke om samhällsförvärvad meningit. På Csv är analys av 16S rDNA främst lämplig vid infektioner i CNS efter neurokirurgiska ingrepp, då andra bakterier förekommer.

Punktat (optimal provvolym 0,5-2 ml, minimum 50 µl) och vävnad (minimum 2-4 mm biopsi) transporteras i sterilt plaströr. Csv (Likvor) tas i sterilt plaströr med konisk botten, se Likvorprov - praktisk handledning

I första hand rekommenderas endast vävnader och vätskor från normalt sett steril provtagningslokal.

OBS! Följande prover kommer generellt att avvisas av laboratoriet:
• Perianalabscess
• Urin
• Prov från munhåla
• Vävnad i buljong
• Sputum, trakealsekret, svalgsekret, nasofarynxsekret
• Ytligt sår i eswab-rör
• Blod och serum
• Csv från akutmottagningar - analyseras i stället med meningit/encefalitpanel, som är snabbare och har bättre sensitivitet för de bakterier som orsakar samhällsförvärvad meningit

Diskussion kan föras med bakteriologikonsult angående analys av udda provmaterial.

Prov förvaras kylt i avvaktan på transport.